Míg az Elnökség a HÖK végrehajtó szerve, addig a Küldöttgyűlés a HÖK döntéshozó szerepét tölti be. Ők választják meg az ELTE GTK HÖK Elnökségét, valamint az Ellenőrző Bizottságot is. Emellett, ők fogadják el a havi elnökségi beszámolókat, és szavazzák meg a HÖK költségvetését is. Egy Küldöttgyűlési Képviselőnek nemcsak arra nyílik lehetősége, hogy belelásson a szervezet működésébe, hanem az ő kezében lesz a demokrácia legnagyobb hatalma, maga a döntés.

Jelentkezésre mindig az őszi félévben van lehetőség, mely során 25 aláírást kell gyűjtened hallgatótársaidtól az érvényes pályázáshoz. Amennyiben az Ellenőrző Bizottság rendben talált mindent, Küldöttgyűlési Képviselő-jelöltté válsz. Azt követően, hogy véglegesedett az érvényes jelentkezéseket leadók listája, meghirdetésre kerül a szavazás. Ez Neptunon keresztül történik, ahol minden hallgatónak joga van leadni titkos szavazatát. Az újdonsült Küldöttgyűlési képviselők pedig az alakuló Küldöttgyűlésen vehetik először kézbe mandátumukat, mellyel megválasztják az ELTE GTK HÖK következő elnökségét.